O sorteio da Proliga 2005/2006 ditou os seguintes jogos:
Atlético – Sampaense
Vitória – Vasco
Angra – Física
Vila Pouca Aguiar – Algés
Sangalhos Desporto Clube – Basket Almada
Académica – Galitos
Esgueira – Diogo Cão
Illiabum – Braga
Angra Basket e Diogo Cão são estreantes na prova, da qual já não fazem parte o Marinhense (desistiu) e Maia (desceu de divisão).