Um método mais sofisticado de análise da informação das sequências possíveis do genoma está a ser desenvolvido na Universidade de Aveiro, através do cruzamento da biologia e da informática.
Um grupo investigador de matemáticos, engenheiros informáticos, físicos e biólogos moleculares da UA desenvolveu software e metodologias biomatemáticas que permitem obter informação global sobre o mecanismo de leitura do mRNA pelo ribossoma.
Segundo a equipa de investigação, “o software desenvolvido monitoriza e lê genomas completos ou parcialmente sequenciados e determina o arranjo de cada tripleto de bases (codão), que compõem as sequências lineares (nucleótidos) dos genes, em relação aos outros. Ao fazê-lo, constrói um mapa genómico de contexto dos codões permitindo a identificação de sequências no mRNA cujo erro de leitura é superior à média de 10-4 a 10-5, e, também, de potenciais pontos de regulação da expressão génica”.
As diversas ferramentas informáticas já desenvolvidas serão integradas num pacote de software único que permite importar, pesquisar e editar sequências de DNA a partir de bases de dados públicas.
O desenvolvimento de novas ferramentas informáticas para visualização da informação e metodologias matemáticas para determinação das leis que governam a tradução do mRNA e para reconstrução de genomas com base no contexto dos codões será a próxima etapa deste projecto, assim como a concepção de uma página na Internet para disponibilizar toda a informação obtida.
Estes estudos «in silico» serão, também, validados com estudos «in vitro» e «in vivo».
As expectativas relativamente à utilidade de um estudo deste género são as melhores. Segundo a equipa de investigação “espera-se que este projecto contribua significativamente para o avanço do conhecimento na evolução e funcionamento dos genoma e desempenhe um papel importante no desenvolvimento deste novo domínio científico em Portugal”.
A equipa, cujo investigador responsável é Manuel A. S. Santos, integra José Luís Oliveira, Miguel Pinheiro, Gaspar Dias, Adelaide Valente e Andreia Hall.
